MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012943	GCA	2	6	43360	43365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796955
1003	NC_012943	CGG	2	6	43387	43392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796955
1004	NC_012943	CAC	2	6	43400	43405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796955
1005	NC_012943	GCC	2	6	43427	43432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796955
1006	NC_012943	GC	3	6	43451	43456	0 %	0 %	50 %	50 %	253796955
1007	NC_012943	CGT	2	6	43506	43511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012943	GTG	2	6	43583	43588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012943	GGC	2	6	43692	43697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796956
1010	NC_012943	CGA	2	6	43709	43714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1011	NC_012943	CCG	2	6	43747	43752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1012	NC_012943	GAC	2	6	43866	43871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1013	NC_012943	CGAC	2	8	43948	43955	25 %	0 %	25 %	50 %	253796956
1014	NC_012943	TGG	2	6	43978	43983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796956
1015	NC_012943	TGC	2	6	43993	43998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1016	NC_012943	CCG	2	6	44029	44034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1017	NC_012943	CGT	2	6	44087	44092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1018	NC_012943	CGC	2	6	44100	44105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1019	NC_012943	CGA	2	6	44139	44144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1020	NC_012943	ACC	2	6	44154	44159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796956
1021	NC_012943	CAA	2	6	44231	44236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796956
1022	NC_012943	GC	3	6	44238	44243	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
1023	NC_012943	GGC	2	6	44295	44300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796956
1024	NC_012943	GAGC	2	8	44328	44335	25 %	0 %	50 %	25 %	253796956
1025	NC_012943	CGA	2	6	44345	44350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1026	NC_012943	CCG	2	6	44431	44436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1027	NC_012943	GAT	2	6	44492	44497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796956
1028	NC_012943	GCT	2	6	44522	44527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1029	NC_012943	CGA	2	6	44528	44533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1030	NC_012943	CAC	2	6	44669	44674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796956
1031	NC_012943	CGA	2	6	44735	44740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1032	NC_012943	CGC	2	6	44747	44752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1033	NC_012943	CGG	3	9	44789	44797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796956
1034	NC_012943	CGC	2	6	44816	44821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1035	NC_012943	CGC	2	6	44837	44842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1036	NC_012943	TCT	2	6	44887	44892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796956
1037	NC_012943	GGTAC	2	10	44965	44974	20 %	20 %	40 %	20 %	253796956
1038	NC_012943	GGGACT	2	12	45010	45021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253796956
1039	NC_012943	CGG	2	6	45062	45067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796956
1040	NC_012943	CAG	2	6	45142	45147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1041	NC_012943	TCG	2	6	45160	45165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1042	NC_012943	TCGAA	2	10	45197	45206	40 %	20 %	20 %	20 %	253796956
1043	NC_012943	CGA	2	6	45299	45304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1044	NC_012943	ACT	2	6	45340	45345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796956
1045	NC_012943	CGA	2	6	45365	45370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1046	NC_012943	GGGC	2	8	45487	45494	0 %	0 %	75 %	25 %	253796956
1047	NC_012943	CGGC	2	8	45582	45589	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
1048	NC_012943	GAC	2	6	45603	45608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1049	NC_012943	CGG	2	6	45632	45637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796956
1050	NC_012943	CTG	2	6	45660	45665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1051	NC_012943	GCTTAC	2	12	45759	45770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253796956
1052	NC_012943	GC	3	6	45777	45782	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
1053	NC_012943	GAA	2	6	45896	45901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796956
1054	NC_012943	TGT	2	6	46010	46015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796956
1055	NC_012943	GTC	2	6	46053	46058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1056	NC_012943	GCACC	2	10	46127	46136	20 %	0 %	20 %	60 %	253796956
1057	NC_012943	TCG	2	6	46138	46143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1058	NC_012943	AGA	2	6	46151	46156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796956
1059	NC_012943	ACC	2	6	46210	46215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796956
1060	NC_012943	AAG	2	6	46221	46226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796956
1061	NC_012943	GCC	2	6	46248	46253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1062	NC_012943	GAG	2	6	46302	46307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796956
1063	NC_012943	ACC	2	6	46329	46334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796956
1064	NC_012943	GCC	2	6	46368	46373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796956
1065	NC_012943	TCG	2	6	46378	46383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1066	NC_012943	GTG	3	9	46434	46442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796956
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1068	NC_012943	CGA	2	6	46454	46459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
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1070	NC_012943	CGA	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796956
1071	NC_012943	GCCG	2	8	46545	46552	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
1072	NC_012943	CGG	2	6	46582	46587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012943	CGC	2	6	46637	46642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_012943	CGG	2	6	46649	46654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_012943	TTGC	2	8	46709	46716	0 %	50 %	25 %	25 %	253796957
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1082	NC_012943	GCC	2	6	46944	46949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796957
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1085	NC_012943	GCA	2	6	47100	47105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796957
1086	NC_012943	CGGTG	2	10	47161	47170	0 %	20 %	60 %	20 %	253796957
1087	NC_012943	ACA	2	6	47300	47305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796957
1088	NC_012943	TCATG	2	10	47307	47316	20 %	40 %	20 %	20 %	253796957
1089	NC_012943	CTAC	2	8	47322	47329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_012943	GCT	2	6	47439	47444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012943	ATCGG	2	10	47454	47463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_012943	GAG	2	6	47482	47487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796958
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1094	NC_012943	CGG	3	9	47566	47574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796958
1095	NC_012943	GCAG	2	8	47622	47629	25 %	0 %	50 %	25 %	253796958
1096	NC_012943	GCG	2	6	47662	47667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796958
1097	NC_012943	CGT	2	6	47693	47698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796958
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1102	NC_012943	CGC	2	6	47999	48004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796958
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1107	NC_012943	GTGC	2	8	48522	48529	0 %	25 %	50 %	25 %	253796959
1108	NC_012943	CGG	2	6	48563	48568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796959
1109	NC_012943	CCG	4	12	48625	48636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796959
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1111	NC_012943	GCAGC	2	10	48701	48710	20 %	0 %	40 %	40 %	253796959
1112	NC_012943	GTC	2	6	48717	48722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796959
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1115	NC_012943	CCCGA	2	10	48784	48793	20 %	0 %	20 %	60 %	253796959
1116	NC_012943	GCCG	2	8	48806	48813	0 %	0 %	50 %	50 %	253796959
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1123	NC_012943	GC	3	6	49186	49191	0 %	0 %	50 %	50 %	253796960
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1125	NC_012943	CGG	2	6	49271	49276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1126	NC_012943	CGA	2	6	49299	49304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1127	NC_012943	GCC	2	6	49305	49310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
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1129	NC_012943	CGG	2	6	49423	49428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1130	NC_012943	CGC	2	6	49442	49447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
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1133	NC_012943	CGA	2	6	49607	49612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
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1140	NC_012943	CAGC	2	8	49991	49998	25 %	0 %	25 %	50 %	253796960
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1142	NC_012943	GTG	2	6	50103	50108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_012943	CAT	2	6	54224	54229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796965
1251	NC_012943	CGG	2	6	54259	54264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796965
1252	NC_012943	AGC	2	6	54295	54300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796965
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1255	NC_012943	CGG	2	6	54361	54366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796965
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1284	NC_012943	GGT	2	6	55620	55625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796965
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1498	NC_012943	CAT	2	6	63674	63679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1499	NC_012943	GTG	2	6	63695	63700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796974
1500	NC_012943	TGC	2	6	63716	63721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974

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